简化的系统发生关系树;B.推测东亚野猪的增殖途径;C.基于东亚家猪和野猪构建的系统发育关系树;D.贝叶斯种群扩张图。
动物的成功驯化对人类社会的发展具有里程碑意义。猪是人类最早驯化的动物之一，在农业社会中发挥着重要作用。它也是研究动物驯化的重要“模型动物”。至少一万到八千年前，在中国的安纳托利亚地区和中原地区，家猪已经被独立驯化。古代DNA研究证实，大约8500年前，安那托利亚的家猪随着新石器时代早期的农业人口进入欧洲，但进入欧洲的家猪继续与欧洲野猪杂交，从而产生了欧洲家猪。只有0-4%的近东祖先的成分被保留下来，表明几乎完全替代。上述研究发现，东亚的情况与欧洲完全不同。本研究选取中国黄河流域42头古猪(来自陕西:渝花寨、羊关寨等;安徽:优奇人寺;河北:小李;青海省喇家遗址)获得高质量线粒体基因组数据。时间跨度大约是7500-2500年前。研究发现，从该遗址出土的一些中国古代猪(25%，可以追溯到新石器时代早期)与东亚的一些现代家猪相同。这表明她们有母性遗传传承，至少可以追溯到新石器时代早期。这一结果支持黄河流域作为一个主要的家庭猪的独立驯化中心。研究还发现，古代家猪的线粒体与活猪的线粒体非常相似。大多数现代国内猪在东亚有着相对较近的线粒体基因组类型,888贵宾会手机版.和人口有一个小的遗传距离值,反映了东亚国内猪可能来自一个祖先种群母性遗传多样性较低也可能与国内猪的育种过程有关。
系统发育分支树分析表明，湄公河流域(包括中国西南部、越南等)是东亚地区大多数家养猪种群(野猪种群)的祖先种群来源。这一地区可能被用作生态上的最后一个冰峰。该保护区帮助保存了大量的母性遗传类型，因此它在所有家猪和野猪种群中具有最高的遗传多样性。根据古代和现代线粒体基因组数据计算突变率，东亚家养猪种群的共同祖先可以追溯到不到2万年。自全新世以来，家猪种群经历了两次大规模的母体有效种群扩张事件，分别始于7000年和4000年前。与发展有关。这也反映了家猪的母性遗传历史与人类社会发展之间的密切联系。
